Quarto:Markdown 又何必只是 Markdown

Quarto可以说是RMarkdown的加强版,相比RMarkdown,将环境给大统一,更好的适配VSCode,你甚至不需要有R环境、安装Rstudio,就能用Quarto写文章和报告。我对Quarto的整体印象,可以概括为“枢纽”二字,能写代码,能与Jupyter Notebook相互转换,能将Markdown导出为各种常用格式,可以当成简易版的LaTex写报告,将Markdown的生态大大强化。

发布于 Writing

设置word模板,Markdown 也能自动转换为美观规范的 Word 文档

介绍下如何更丝滑的把 Markdown 初步导出成满意的 Word 样式的

发布于 Writing

Windows 笔记本电脑查看电池使用情况

不需要其他软件,直接用cmd命令就可以就可以详细查看笔记本电脑电池的使用情况

发布于 搞机

tree 查看文件目录神器

tree能以树状图列出目录的内容,非常适合概览项目结构。

发布于 配置

Python 上传包到pypi

阿巛同学第一个上传到Pypi的包

发布于 Coding

RNAseq 分析:Tophat2+cufflinks+cuffdiff+差异基因分析

复旦大学《实用生物信息学》第一次作业,使用Tophat2-cufflinks-cuffdiff流程来进行RNAseq差异基因分析

发布于 生信

PSSM矩阵计算

PSSM(Position-Specific Scoring Matrix)是从MSA中构建的,实际上就是相同长度的一组序列根据各个位点氨基酸(碱基)频率计算得到的的权值矩阵,许多motif寻找软件的组成部分。

发布于 生信

用Python实现Needleman-Wunsch和Smith-Waterman算法

Needleman-Wunsch和Smith-Waterman算法都是Pairwise alignment算法,用于双序列比对。Needleman-Wunsch是全局序列比对算法,最终会得到2条序列在全局上最佳的匹配结果(e.g. 最多的match数量、最高的比对得分、最高的identity)。Smith-Waterman是局部序列比对算法,最终得到的是2条序列在局部的最佳匹配片段(注意:即挑选出得分最高的比对片段)

发布于 生信