tree 查看文件目录神器

tree能以树状图列出目录的内容,非常适合概览项目结构。

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#Windows#Linux

Python 上传包到pypi

阿巛同学第一个上传到Pypi的包

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#编程#Python

RNAseq 分析:Tophat2+cufflinks+cuffdiff+差异基因分析

复旦大学《实用生物信息学》第一次作业,使用Tophat2-cufflinks-cuffdiff流程来进行RNAseq差异基因分析

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#作业#组学分析#生信

PSSM矩阵计算

PSSM(Position-Specific Scoring Matrix)是从MSA中构建的,实际上就是相同长度的一组序列根据各个位点氨基酸(碱基)频率计算得到的的权值矩阵,许多motif寻找软件的组成部分。

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#作业

用Python实现Needleman-Wunsch和Smith-Waterman算法

Needleman-Wunsch和Smith-Waterman算法都是Pairwise alignment算法,用于双序列比对。Needleman-Wunsch是全局序列比对算法,最终会得到2条序列在全局上最佳的匹配结果(e.g. 最多的match数量、最高的比对得分、最高的identity)。Smith-Waterman是局部序列比对算法,最终得到的是2条序列在局部的最佳匹配片段(注意:即挑选出得分最高的比对片段)

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#作业#生信

【Github】cdn jsdelivr加速使用方法

如果图床选用GitHub,建议不要cdn加速,图片链接直接用原本链接,起码能保证图片不失效。

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#Github#图床
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